Основой и залогом успеха ЦФХМА является коллектив, состоящий из квалифицированных научных кадров, способный решать большой круг научно-исследовательских и производственных задач в химическом, фармацевтическом, химико-технологическом, биолого-технологическом, гидрометаллургическом и нефтегазовом секторах республики.
Сегодня в ЦФХМА работает свыше 150 человек (в том числе 23 доктора наук и более 30 PhD-докторов и кандидатов наук). Высокий профессиональный уровень сотрудников ЦФХМА неоднократно подтверждался высшими наградами Республики Казахстан, победами в различных конкурсах, в том числе международных.
Постановлением Правительства Республики Казахстан от 16 ноября 2005 г от имени президента РК Н.А.Назарбаева сотрудникам Центра - Наурызбаеву М.К., Ишкенову Э.Р., Светову В. А. присуждены Государственные премии Республики Казахстан в области науки, техники и образования.
Государственные научные стипендии Республики Казахстан для ученых, внесших выдающийся вклад в развитие науки и техники, были присвоены профессорам Абилову Ж.А., Ахмедовой Ш.С., Бурашевой Г.Ш., Куанышевой Г.С., Музычкиной Р.А., Мусабекову К.Б., Наурызбаеву М.К., Нурахметову Н.Н., Оспанову Х.К., Тажибаевой С.М.
Звания “Заслуженный деятель науки Казахстана” удостоены Зебрева А.И., Нурахметов Н.Н., Мусабеков К.Б.
Перспективы развития Центра обеспечивают молодые кадры. В разные годы 9 молодых исследователей были удостоены звания Лауреатов Государственной премии имени Д. А. Кунаева за лучшие научные работы в области науки и техники: в 2005 году - Курбанова А., Кенесов Б., Тасибеков Х., в 2006 году - Байжуманова А., Нечипуренко С., Соколов А., в 2008 году - Кудреева Л., Куванчева А., Тулегенов А.
Государственных научных стипендий для талантливых молодых ученых были удостоены 10 сотрудников Центра.